Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCM1Q15154 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCM1Q15154 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms