Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCLAFQ15004 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms