Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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KCNAB1Q14722 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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KCNAB1Q14722 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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KCNAB1Q14722 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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KCNAB1Q14722 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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KCNAB1Q14722 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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KCNAB1Q14722 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KCNAB1Q14722 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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