Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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