Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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