Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CALCOCO2Q13137 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO2Q13137 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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