Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FOXO1Q12778 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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