Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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IRF8Q02556 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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IRF8Q02556 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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IRF8Q02556 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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IRF8Q02556 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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IRF8Q02556 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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IRF8Q02556 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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IRF8Q02556 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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IRF8Q02556 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IRF8Q02556 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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