Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms