Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms