Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTBP2P56545 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTBP2P56545 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms