Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB3P54753 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB3P54753 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms