Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms