Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC3P51654 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPC3P51654 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms