Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTBRP36941 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms