Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EFNA1P20827 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EFNA1P20827 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.3 ms