Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC9A1P19634 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms