Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRAP18433 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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