Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms