Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX6O95503 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX6O95503 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX6O95503 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX6O95503 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms