Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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