Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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NPIPB9F8W1W9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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