Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms