Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTF2Q9UNY4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms