Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 5694.4 ms