Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5BQ9UGL1 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms