Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms