Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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