Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ASCL3Q9NQ33 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms