Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC3Q9BY71 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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