Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms