Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NDFIP1Q9BT67 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms