Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms