Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms