Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC12Q8WUD4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms