Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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