Protein–RNA interactions for Protein: Q8N319

C6orf223, Uncharacterized protein C6orf223, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223Q8N319 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C6orf223Q8N319 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C6orf223Q8N319 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms