Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SYT9Q86SS6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SYT9Q86SS6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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