Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CBLN3Q6UW01 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms