Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NANOGP8Q6NSW7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms