Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TNS3Q68CZ2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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TNS3Q68CZ2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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TNS3Q68CZ2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNS3Q68CZ2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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