Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 IL36G-201ENST00000259205 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 PLAC8-201ENST00000311507 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 FAM19A2-201ENST00000416284 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC096751.2-201ENST00000507483 792 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
OBSCNQ5VST9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms