Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms