Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SP6Q3SY56 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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