Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms