Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms