Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TRIP13Q15645 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TRIP13Q15645 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TRIP13Q15645 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TRIP13Q15645 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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