Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TAF11Q15544 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms