Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CDSNQ15517 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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