Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAM2Q15035 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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